Les 5 meilleures distributions Linux pour la science

By Corentin BURTIN

Il y a une distribution Linux pour tout le monde, même pour les chercheurs. Voici les meilleures distributions Linux scientifiques que vous devez essayer si vous vous intéressez à la science.

Si la plupart des distributions Linux sont polyvalentes, certaines distributions spécialisées sont fournies avec certains types de logiciels de recherche. Après tout, l’histoire de Linux a commencé dans les laboratoires de recherche et, aujourd’hui, Linux équipe les serveurs et les stations de travail des plus grands organismes de recherche du monde.

Vous pouvez transformer votre système Linux ordinaire en une distro scientifique en installant les mêmes applications, mais l’intérêt de ces distributions est d’éviter la recherche d’applications individuelles.

Au lieu de cela, elles offrent un moyen rapide de déployer Linux dans les installations de recherche, les établissements d’enseignement, sur les ordinateurs des étudiants et des utilisateurs curieux de science. Si vous faites partie de ces derniers, voici cinq excellentes distributions scientifiques à considérer.

CAELinux

L’indice est dans le nom : CAE est l’acronyme de Computer-Aided Engineering (ingénierie assistée par ordinateur), et cette distro scientifique est parfaite pour tous ceux qui travaillent avec la CAO, la modélisation, le prototypage, l’impression 3D et les simulations physiques. Développée en Suisse, elle est maintenue par Joël Cugnoni et a été mise à jour pour la dernière fois en 2020.

Même s’il n’y a pas eu de nouvelles versions pour cette distro, les développeurs soutiennent de tout cœur les versions existantes.

La dernière version de CAELinux est basée sur Xubuntu 18.04 LTS et nécessite un système 64 bits avec 4 Go de RAM. Si vous avez l’intention de l’utiliser à des fins professionnelles, vous aurez besoin de 8 Go de RAM ou plus, pour tirer le meilleur parti de cette distro.

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Elle n’offre pas d’autres saveurs de bureau que Xfce, mais sa sélection de logiciels est impressionnante. Rassurez-vous, en plus des applications spécifiques, elle est livrée avec les applications préinstallées habituelles, qui sont natives de Xfce. Puisqu’il s’agit d’une distro à vocation scientifique, il est préférable d’installer quelques applications supplémentaires que vous utiliserez régulièrement.

Voici quelques excellentes applications :

SALOME : CAO 3D et maillage
Gmsh : Modélisation géométrique
Scilab : Programmation mathématique
ParaView : Visualisation 3D
ImageJ : Traitement et analyse d'images
Elmer : Modèles physiques complexes

CAELinux est disponible gratuitement sous forme d’image ISO vivante. Vous pouvez également commander une copie physique à un prix abordable.

Fedora scientifique

Cette version de Fedora représente le juste milieu entre une distribution Linux hautement spécialisée et une distribution ordinaire. En tant que telle, elle est idéale pour les chercheurs et les étudiants de tous horizons scientifiques, bien qu’elle penche légèrement en faveur de la recherche numérique.

L’environnement de bureau par défaut est KDE, et Fedora Scientific est disponible pour les architectures 32 et 64 bits. Il a été développé par Amit Saha avec le soutien de Fedora Science and Technology SIG. La documentation détaillée en ligne vous présentera Fedora Scientific et vous guidera dans la sélection de ses logiciels.

Parmi les logiciels les plus remarquables, citons

Maxima : Une suite complète d'algèbre
LaTeX : Création de documents et de présentations
Mayavi : visualisation de données en 3D et contrôle de version
Trifecta : git, Mercurial, et Subversion

Vous pouvez télécharger Fedora Scientific Live DVD soit par téléchargement direct, soit par torrent.

Lin4Neuro

Interface de bureau de Lin4Neuro

Lin4Neuro (L4N) est la réponse open-source aux calculs biotechnologiques sophistiqués. Cette distribution basée sur Ubuntu vous donne accès à une suite diversifiée de logiciels d’analyse de neuro-imagerie. Kiyotaka Nemoto a créé cette distro ; il est membre de la faculté de médecine de Tsukuba, au Japon.

L’avantage le plus significatif de Lin4Neuro est que vous pouvez profiter d’une chaîne d’outils entièrement open-source. 3D Slicer contribue aux algorithmes d’analyse d’image pour la résonance magnétique fonctionnelle, l’imagerie tensorielle, la thérapie guidée visuellement, etc.

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Parmi les autres applications, citons AFNI, qui aide à traiter et à afficher les données IRM. L’analyseur et le visualiseur de connectomes aident à la DSI, tandis que les connectomes DTI et QBall sont utiles pour la neuroimagerie multimodale et multi-échelle et la visualisation basée sur Python.

Certains des outils de Lin4Neuro, tels que Virtual MRI et MITK, font de L4N un outil idéal pour l’étude et la recherche en neurosciences. La distribution facilite la mise à l’échelle et la conversion de l’imagerie médicale avec MRIConvert.

Sur Lin4Neuro, MRIConvert est disponible dans le dépôt NeuroDebian. La distro a récemment gagné en popularité en tant que plateforme libre pour l’analyse de données et le traitement d’images médicales.

Lin4Neuro est redistribuée comme un cadre orienté neurosciences avec sa licence BSD. Elle fait office de distribution live portable et vous pouvez l’exécuter via USB pour mettre en place un centre médico-légal de neuroscience n’importe où.

Fedora Astronomy Suite

Saviez-vous que l’observation des étoiles est devenue un logiciel libre ? La Fedora Astronomy Suite s’adresse aux professionnels et aux amateurs, notamment pour répondre à leurs besoins en matière d’informatique astronomique. La distribution vous offre un écosystème KDE basé sur Python. Fedora Astronomy Suite met à votre disposition une multitude d’outils puissants d’analyse et de visualisation des données astronomiques.

Vous pouvez utiliser les bibliothèques communautaires Python comme AstroPy, de puissantes applications d’édition graphique comme Siril et GIMP, des logiciels d’astrosimulation comme Celestia, l’automatisation des instruments astronomiques et des logiciels de contrôle comme INDI. La documentation substantielle d’Astronomy Suite permet aux astronomes en herbe d’étudier facilement n’importe quel endroit sur Terre et au-delà.

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L’automatisation du contrôle d’instruments tels que les télescopes et les caméras vous permet de réaliser des astrophotographies haute résolution à tout moment.

Néanmoins, le point fort des progiciels fournis est le référentiel AstrOmatic pour le développement de logiciels astronomiques avancés. Simplifiez la correction des couleurs de l’imagerie cosmique, même la plus avancée, avec des outils comme Redshift dans la suite Astronomy.

Fedora Robotics Suite

Fedora Robotics Suite vous offre un environnement de développement complet pour la programmation de logiciels et de matériel. Il s’agit d’une version dérivée de la distribution Fedora Linux, qui comprend des progiciels destinés à faciliter les environnements de simulation robotique.

Fedora Robotics Suite est une distribution vivante et portable que vous pouvez utiliser comme cadre personnalisé pour des projets de robotique. Les utilisateurs peuvent s’attendre à trouver certaines des applications et des cadres de programmation en amont les plus remarquables, notamment Fawkes, Player/Stage, RoboCup 3D Soccer Server, Gazebo, SimSpark, etc. Fedora intègre même l’IDE Eclipse pour le développement de scripts robotiques multilingues.

Pratiquez la programmation, la simulation et les opérations simplifiées avec les bibliothèques intégrées de la Robotics Suite, telles que MRPT, PCL, OpenCV, etc. Des bibliothèques d’accessoires matériels sont fournies avec la Robotics Suite pour les dispositifs robotiques les plus courants, tels que les scanners laser Hokuyo et le bras robotique Katana.

Robotics Suite est accompagné d’une documentation complète qui accélère la prise en main par les novices en robotique.

Choisir la meilleure distro Linux scientifique pour vous-même

Quel que soit le domaine scientifique qui vous intéresse, vous devriez être en mesure de choisir une distribution appropriée dans cette liste. Chacune des distributions énumérées ci-dessus est la meilleure dans sa catégorie et offre des logiciels, des applications et des services inégalés aux utilisateurs finaux.